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　　IMIM（Hospital del Mar Medical Research Institute）和Pompeu Fabra大學(xué)的生物信息學(xué)家使用分子模擬技術(shù)揭示了HIV病毒成熟的關(guān)鍵步驟，幫助人們進(jìn)一步了解新生惰性病毒發(fā)展成為傳染性病毒的過(guò)程，這對(duì)于病毒復(fù)制來(lái)說(shuō)至關(guān)重要。該研究發(fā)表在最近一期的美國(guó)國(guó)家科學(xué)院院刊PNAS雜志上，將有助于日后設(shè)計(jì)抗逆轉(zhuǎn)錄病毒的新藥物。

　　HIV病毒成熟并變得具有感染性是HIV蛋白酶的作用結(jié)果。這種蛋白就像一把剪刀，能將連在一起的多蛋白長(zhǎng)鏈切開(kāi)，而被切下的蛋白會(huì)形成新病毒的傳染性結(jié)構(gòu)。整個(gè)HIV成熟過(guò)程中最令研究人員感興趣的問(wèn)題是，HIV蛋白酶（“蛋白剪刀”）從蛋白長(zhǎng)鏈中解離出來(lái)的機(jī)制。

　　在HIV的成熟過(guò)程中，蛋白要從多蛋白長(zhǎng)鏈中剪切下來(lái)以后才能執(zhí)行功能。對(duì)于HIV蛋白酶來(lái)說(shuō)也是這樣。研究人員采用分子模擬軟件ACEMD和GPUGRID.net技術(shù)，展示了“蛋白剪刀”將自身從多蛋白鏈中剪切出來(lái)的過(guò)程。研究顯示，HIV蛋白酶的一端（N端）會(huì)與自身活性位點(diǎn)結(jié)合，然后切開(kāi)自身與其余蛋白鏈之間的化學(xué)鍵切開(kāi)。這是整個(gè)HIV成熟過(guò)程的第一步，研究人員指出若能在成熟過(guò)程阻斷HIV蛋白酶，就能夠使病毒顆粒無(wú)法成熟，也就不能產(chǎn)生有傳染性的病毒。

　　GPUGRID.net計(jì)算平臺(tái)有些類(lèi)似于一個(gè)虛擬的超級(jí)計(jì)算機(jī)，其計(jì)算能力比以CPU為基礎(chǔ)的電腦高十倍。GPUGRID.net所提供的計(jì)算能力，在此之前只有價(jià)值數(shù)百萬(wàn)美元的超級(jí)計(jì)算機(jī)才能做到，這一平臺(tái)為人們大大節(jié)省了研究經(jīng)費(fèi)。研究人員在此平臺(tái)上處理了大量數(shù)據(jù)，進(jìn)行了數(shù)千個(gè)計(jì)算機(jī)模擬，并最終完成了高度復(fù)雜的模擬模型。

　　HIV病毒感染引發(fā)的艾滋病是一種免疫缺陷性疾病，目前全球有數(shù)百萬(wàn)人感染了艾滋病。HIV病毒直接攻擊并削弱人體免疫系統(tǒng)，使患者的免疫系統(tǒng)更容易遭受攻擊。這項(xiàng)研究利用計(jì)算機(jī)技術(shù)，展示了關(guān)鍵酶自我剪切并起始HIV成熟過(guò)程的機(jī)制，使人們進(jìn)一步了解了HIV生命周期中的關(guān)鍵步驟。研究人員指出，在這項(xiàng)新發(fā)現(xiàn)的基礎(chǔ)上，人們有望研制出新型的艾滋病治療藥物。