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中科院開發(fā)出預(yù)測(cè)抗癌藥物活性的網(wǎng)頁(yè)服務(wù)器

2012-12-15 20:55 閱讀:1302 來源:愛愛醫(yī) 責(zé)任編輯:鄺兆進(jìn)
[導(dǎo)讀] 建立一個(gè)高效、可靠、準(zhǔn)確的抗癌藥物的計(jì)算生物學(xué)篩選系統(tǒng)對(duì)發(fā)掘新的抗癌藥物具有重要意義。

  癌癥是目前世界人口死亡的第一原因。全世界每年因癌癥死亡的人口超過720萬人。而在中國(guó),每年因癌癥死亡的人口也超過了170萬。因此,開發(fā)新的抗癌藥物是科學(xué)界和醫(yī)學(xué)界的熱點(diǎn)和難點(diǎn)。但直接采用實(shí)驗(yàn)的方法篩選抗癌藥物具有花費(fèi)大、時(shí)間長(zhǎng)的特點(diǎn)。以小分子為例,現(xiàn)在已知的小分子化合物超過了1000萬個(gè),因此直接采用實(shí)驗(yàn)的方法從這1000萬個(gè)化合物中篩選藥物小分子幾乎是不可能的。因此建立一個(gè)高效、可靠、準(zhǔn)確的抗癌藥物的計(jì)算生物學(xué)篩選系統(tǒng)對(duì)發(fā)掘新的抗癌藥物具有重要意義。

  為了建立抗癌藥物活性的計(jì)算生物學(xué)預(yù)測(cè)系統(tǒng),在中國(guó)科學(xué)院昆明動(dòng)物研究所生物信息與系統(tǒng)生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室黃京飛研究員的指導(dǎo)下,李功華博士開發(fā)了一個(gè)新的基于分子藥效團(tuán)的小分子比對(duì)算法,并將該算法應(yīng)用于預(yù)測(cè)小分子的抗癌活性。通過交叉驗(yàn)證,其得到的結(jié)果令人振奮:其預(yù)測(cè)的線下面積(AUC)達(dá)到了0.878,顯示該算法能很好的預(yù)測(cè)藥物小分子的抗癌活性。為了使該算法能被不同學(xué)科的研究者和醫(yī)藥工作者應(yīng)用,李功華博士開發(fā)了一個(gè)簡(jiǎn)便易用的預(yù)測(cè)抗癌藥物活性的網(wǎng)頁(yè)服務(wù)器(http://bsb.kiz.ac.cn/CDRUG/)

 


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